弗朗西斯科·哈维尔于1757年2月15日出生在卡塞塔王宫，他是西班牙国王卡洛斯三世（当时是那不勒斯和西西里国王）与萨克森的玛丽亚·阿玛莉亚公主的第十三个孩子和第六个儿子，也是最小的孩子。在父亲成为西班牙国王后，弗朗西斯科·哈维尔也从那不勒斯王子变成西班牙王子，并于1759年10月17日与父母和哥哥姐姐们（除继承那不勒斯的费迪南多一世外）乘船抵达巴塞罗那。一年后即1760年9月，他失去了母亲玛丽亚·阿玛莉亚王后，只能由父亲照顾。他曾是金羊毛骑士团（西班牙）、圣灵骑士团（法国）和圣吉纳罗骑士团（那不勒斯和西西里）的骑士，到达西班牙后，他得到了卡拉特拉瓦骑士团的阿尔卡尼兹、曼萨纳雷斯、弗雷斯内达和拉法莱斯的支持。然而，由于健康状况恶化，1771年4月10日，他在十四岁时在阿兰胡埃斯王宫去世，遗体被安葬在埃斯科里亚尔修道院的王子神殿。